Laparoskopia jest wykorzystywana w leczeniu wielu chorób wewnętrznych. Wykorzystuje się ją do leczenia wątroby, jamy brzusznej czy śledziony. Laparoskopia znalazła swoje zastosowanie również w ginekologii. W tej dziedzinie medycyny wykorzystuje się ją, by leczyć niedrożność jajowodów oraz endometriozę, a także usunąć zrosty, polipy i guzy.
Ponadto laparoskopia może mieć również zastosowanie diagnostyczne. Dzięki zabiegowi lekarz może ocenić stan i budowę narządów płciowych, a także zbadać ciążę pozamaciczną. Laparoskopia ginekologiczna należy do inwazyjnych metod leczenia niepłodności.